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更新時間:2020-04-08
簡要描述:
口蹄疫病毒試劑盒熒光PCR法利用Taq-man實時熒光PCR原理,定性篩查檢測炭疽桿菌,對疾病診斷、醫(yī)治療效及醫(yī)院環(huán)境評估有重要指導(dǎo)意義【檢驗原理】 口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,F(xiàn)MDV) 屬于小RNA病毒科,口蹄疫病毒屬,主要侵害偶蹄獸,有O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和Asia-I七個血清型。口蹄疫發(fā)病以發(fā)熱、口腔黏膜及蹄部和乳房皮膚發(fā)生水
口蹄疫病毒試劑盒熒光PCR法
參數(shù)規(guī)格
英文名稱:s Detection Kit (Real-Time PCR Method)
規(guī)格:50T/盒
【預(yù)期用途】口蹄疫病毒試劑盒熒光PCR法利用Taq-man實時熒光PCR原理,定性篩查檢測炭疽桿菌,對疾病診斷、醫(yī)治療效及醫(yī)院環(huán)境評估有重要指導(dǎo)意義
【檢驗原理】 口蹄疫病毒(Foot and Mouth Disease Virus,F(xiàn)MDV) 屬于小RNA病毒科,口蹄疫病毒屬,主要侵害偶蹄獸,有O、A、C、SAT1、SAT2、SAT3和Asia-I七個血清型??谔阋甙l(fā)病以發(fā)熱、口腔黏膜及蹄部和乳房皮膚發(fā)生水泡和潰爛為特征,是獸疫局規(guī)定的A類傳染病,易通過空氣傳播,傳染性強(qiáng),流行迅速,偶爾感染人。由于口蹄疫傳播迅速、難于防治、補(bǔ)救措施少,被稱為畜牧業(yè)的“*殺手”。
本試劑盒針對口蹄疫病毒A型的高度保守區(qū)域設(shè)計特異性引物和探針,在反應(yīng)體系中含口蹄疫病毒A型基因組模板的情況下,PCR反應(yīng)得以進(jìn)行并釋放熒光信號。利用熒光定量PCR儀對PCR過程中相應(yīng)通道信號進(jìn)行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結(jié)果的定性分析。
配件
口蹄疫病毒(通用型)檢測試劑盒(實時熒光PCR法)的組成
2. 標(biāo)本采集,方法如下:注:陰性對照為基因組DNA,陽性對照為失去活性的病毒cDNA。
儲存方式
避光-20℃以下保存,避免反復(fù)凍融,有效期12個月。
【適用儀器 】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列、Roche LightCycler R480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。
標(biāo)本要求
1. 適用標(biāo)本類型:發(fā)病動物血液、空腸及小腸腸內(nèi)容物及組織臟器(腸道組織、腸系膜及淋巴結(jié)等)和病毒培養(yǎng)液。
(1) 血清:用一次性注射器取靜脈血2-3ml,轉(zhuǎn)至5ml 的干燥管中,密閉送檢。
(2) 腸內(nèi)容物:無菌條件下取腸道內(nèi)容物約1g 左右,置入1ml 含有1.0ml PBS(或生理鹽水)的5ml 離心管中,立即送檢。
(3) 組織臟器:取發(fā)病動物腸道組織及腸系膜淋巴結(jié)等組織約1g,置一1.5ml的潔凈離心管中,密閉送檢。
3.應(yīng)避免標(biāo)本間交叉污染。
4.標(biāo)本收集后可立即檢測;若不能立即檢測,可置于2~8℃冷藏過夜保存;如需長期保存,標(biāo)本應(yīng)凍存于-80℃以下,避免反復(fù)凍融。
【檢驗方法】口蹄疫病毒試劑盒熒光PCR法
1. 試劑準(zhǔn)備(試劑準(zhǔn)備區(qū))
(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。
(2)核算當(dāng)次實驗所需要的反應(yīng)數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應(yīng)體系計算當(dāng)次實驗所需要的各種試劑量。
n =陰性對照數(shù)(1T)+陽性對照數(shù)(1T)+誤差預(yù)留量(1T)+樣本數(shù)
單反液配制表(每份) | RT-PCR反應(yīng)液 | 15.0 μL |
逆轉(zhuǎn)錄酶 | 2.0 μL | |
Taq酶 | 3.0 μL |
(3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應(yīng)管。
2.樣本準(zhǔn)備(樣本處理區(qū))
用QIAGEN、Roche公司RNA提取試劑盒提取RNA,具體操作按照其試劑盒說明書操作。
3.加樣
在上述制備好的PCR反應(yīng)樣本管中分別加入處理好的待測標(biāo)本RNA各5 μl、終體積25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器 上。陰性對照和陽性對照管則各加5 μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25 μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器 上。
4. PCR(PCR擴(kuò)增區(qū))
(1)取樣本處理區(qū)準(zhǔn)備好的PCR反應(yīng)管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應(yīng)位置,并記錄放置順序。
(2)按下表設(shè)置儀器 核酸擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
操作流程
反應(yīng)體積 | 25 μL | 通道選擇 | FAM通道采集病毒熒光信號 |
PCR 反應(yīng) 條件 | 步驟 | 條件 | 循環(huán)數(shù) |
反轉(zhuǎn)錄 | 42℃:10分鐘(min) | 1 | |
預(yù)變性 | 95℃:3分鐘(min) | 1 | |
預(yù)擴(kuò)增 | 95℃:5秒(s) | 5 | |
55℃:40秒(s) | |||
PCR擴(kuò)增 | 95℃:5秒(s) | 40 | |
55℃:40秒(s) (此階段結(jié)束時采集熒光信號) |
注:ABI系列熒光PCR儀在設(shè)置時不選ROX校正,設(shè)置淬滅基團(tuán)選擇None。
適用范圍【參考值】
1.試劑盒有效性判定:
(1)陽性對照:有典型S型擴(kuò)增曲線或Ct值≤35。
(2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。
2.標(biāo)本結(jié)果判定:
(1)陽性:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長期。
(2)可疑:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值在35~38范圍內(nèi)。此時應(yīng)對標(biāo)本進(jìn)行重復(fù)檢測,如重復(fù)實驗結(jié)果Ct值仍在35~38范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。
(3)陰性:標(biāo)本檢測結(jié)果Ct值>38或無Ct值。
測試報告【檢驗結(jié)果的解釋】
通道及檢測結(jié)果 | 標(biāo)本檢測結(jié)果解釋 |
FAM | |
陽性(+) | 標(biāo)本中檢出病毒RNA |
陰性(-) | 標(biāo)本中未檢出病毒RNA |
【檢驗方法的局限性】
1. 當(dāng)檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的檢出*可能會發(fā)生假陰性的結(jié)果。
2. 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當(dāng)容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結(jié)果。
3. 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結(jié)果。
【產(chǎn)品性能指標(biāo)】 口蹄疫病毒試劑盒熒光PCR法的檢出限為102 Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤5%。
操作流程
1. 整個檢測過程應(yīng)嚴(yán)格按照本說明書要求分別在試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣本處理區(qū)和PCR擴(kuò)增區(qū)進(jìn)行操作,各區(qū)實驗服、儀器 、耗材應(yīng)獨立使用,不能混用;實驗用吸頭采用帶濾芯吸頭;樣本處理區(qū)應(yīng)配有生物安全柜,樣本處理在生物安全柜中進(jìn)行操作;三個區(qū)應(yīng)該配有紫外線殺菌裝置。
2. 為避免RNA降解,樣本處理過程應(yīng)在0-4℃條件下操作,且完成實驗后立即上機(jī)檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應(yīng)經(jīng)過無核酶處理。
3. 每次實驗應(yīng)該設(shè)置陰、陽性對照。
4. 試劑盒所有試劑在使用前應(yīng)該在常溫下充分融化混勻,并應(yīng)瞬時離心。
5. 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽性對照在一次使用前應(yīng)全部轉(zhuǎn)移至標(biāo)本準(zhǔn)備區(qū),并單獨存放。
6. 為防止熒光干擾,應(yīng)避免裸手直接接觸PCR反應(yīng)管,并應(yīng)避免在PCR反應(yīng)管上進(jìn)行任何標(biāo)記。
7. 儀器 擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)應(yīng)按照本說明書相關(guān)要求進(jìn)行設(shè)置;不同批號試劑不能混用。
8. ABI系列熒光定量PCR儀參數(shù)設(shè)置中不選ROX校正,淬滅基因選擇None。
9. 實驗過程中產(chǎn)品的廢棄物應(yīng)該進(jìn)行無害化處理后方可丟棄。
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